85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0217 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  850    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.531455  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0352  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.97 
 
 
392 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0028801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.42 
 
 
363 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.38 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.27 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.43 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0622  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.69 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.421879  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  27.17 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.22 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.08 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.1 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  23.24 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13340  4Fe-4S protein  27.41 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.79 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.68 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.51 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  26.21 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06190  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  27.41 
 
 
401 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348561  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.07 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.81 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.63 
 
 
383 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.64 
 
 
307 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.41 
 
 
374 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.96 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0837451  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  26.86 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3118  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.11 
 
 
674 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  38.96 
 
 
553 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.38 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.187801  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  38.96 
 
 
553 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.27 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  18.92 
 
 
335 aa  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1301  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.25 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
285 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.517717  normal  0.0153359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.48 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2944  iron-sulfur cluster-binding protein  44.07 
 
 
155 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.75 
 
 
284 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.93 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.906646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 
710 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.14 
 
 
559 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  52.27 
 
 
252 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00105058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.39 
 
 
553 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1123  iron-sulfur cluster-binding protein  35.06 
 
 
553 aa  46.6  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  34.07 
 
 
413 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.81 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.81 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.86 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.81 
 
 
553 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
553 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
553 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.51 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3878  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1390  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  28.68 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 
557 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.85 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.51 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  19.27 
 
 
547 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.02 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08470  4Fe-4S protein  24.58 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.576639  normal  0.359162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10903  NADPH:adrenodoxin oxidoreductase fprB  37.1 
 
 
575 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0477  coenzyme F420 hydrogenase  38.6 
 
 
252 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.09 
 
 
563 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  30.77 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  43.4 
 
 
102 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  50 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0824  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.43 
 
 
557 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  26.71 
 
 
580 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.97 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.796318  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5499  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
679 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948929  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.1 
 
 
553 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 
559 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  36.07 
 
 
140 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
455 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 
672 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  35.53 
 
 
726 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 
170 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.12789  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2672  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.37 
 
 
180 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0219077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.27 
 
 
545 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  32.88 
 
 
998 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.48 
 
 
680 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2353  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  33.85 
 
 
712 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.09 
 
 
560 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>