76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4221 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 383 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  23.01 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.5 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.01 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.81 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.906646 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.01 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0352  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0028801  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.35 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.5 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.4 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13340  4Fe-4S protein  22.62 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.531455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.28 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0622  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.62 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.421879  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.21 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.09 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.24 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  20.4 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.94 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.74 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.11 
 
 		 552 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  21.29 
 
 		 425 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.187801  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  22.44 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.78 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.4 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0837451  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.64 
 
 		 671 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.42 
 
 		 455 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06190  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  21.17 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  50 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  20.06 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08470  4Fe-4S protein  22.09 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.576639  normal  0.359162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  17.98 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.1 
 
 		 455 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.32 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.45 
 
 		 260 aa  46.6  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06800  4Fe-4S protein  19.71 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.457517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.517717  normal  0.0153359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.04 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.63 
 
 		 559 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.12 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  21.92 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  34.92 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.32 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.62 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.71 
 
 		 674 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  40.82 
 
 		 140 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 		 640 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1301  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.83 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3193  electron transport complex protein rnfB  32 
 
 		 188 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.676371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  32.14 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  29.35 
 
 		 810 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24630  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  28.32 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.538569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  35.85 
 
 		 277 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.22 
 
 		 667 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.76 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0989  ferredoxin  46.34 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.75 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3932  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.86 
 
 		 188 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.16 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.38 
 
 		 756 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  20.78 
 
 		 553 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.71 
 
 		 559 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.62 
 
 		 553 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  27.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.91 
 
 		 212 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000613847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  20.78 
 
 		 553 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  33.33 
 
 		 641 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>