24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06800  4Fe-4S protein  100 
 
 		 377 aa  783    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.457517 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.51 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13340  4Fe-4S protein  23.48 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.92 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.08 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.91 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.581713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.41 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  19.45 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  24.4 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19.71 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.49 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.58 
 
 		 307 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  21.59 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.15 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06190  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  21.52 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.45 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0238  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  24.49 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.42 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.44 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08470  4Fe-4S protein  21.2 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.576639  normal  0.359162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.64 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.04 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.59 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>