More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3193 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3193  electron transport complex protein rnfB  88.3 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3932  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  87.77 
 
 		 188 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  47.19 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.36 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.29 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.35 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  45.35 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  45.35 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  45.66 
 
 		 207 aa  150  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  45.66 
 
 		 207 aa  150  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  41.9 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  44.77 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  45.83 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  45.66 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  45.71 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.58 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.26 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  43.5 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.19 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  44.97 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  44.97 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  46.89 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  44.97 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  44.97 
 
 		 192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  44.97 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.32 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  46.89 
 
 		 193 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  46.89 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  46.29 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.89 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  43.71 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  44 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  47.13 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  47.31 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  46.33 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  44.17 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  40.8 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  45.62 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  44.17 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  42.61 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  45.57 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  44.44 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  42.94 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  41.88 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  41.92 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  42.7 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  40.46 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  43.02 
 
 		 178 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  42.61 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  44.3 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.02 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  42.46 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  42.77 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  41.88 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.55 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  44.65 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  43.75 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.16 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  43.48 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  41.8 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  42.37 
 
 		 681 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  42.38 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.38 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.4 
 
 		 209 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2990  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.02 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.45 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  43.85 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  38.85 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.06 
 
 		 404 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.86 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.86 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  44.44 
 
 		 137 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.03 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.09 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  41.67 
 
 		 291 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  44.53 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  41.78 
 
 		 316 aa  104  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  41.78 
 
 		 316 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.53 
 
 		 259 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  39.74 
 
 		 279 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  41.78 
 
 		 290 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1498  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.01 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.07 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.67 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>