92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3744 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  39.38 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  39.38 
 
 
287 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  39.38 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  39.38 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2722  putative polyferredoxin  39 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.7 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.15 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
371 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.74 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.23 
 
 
377 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.21 
 
 
368 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.85 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  29.86 
 
 
376 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.03 
 
 
368 aa  50.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
656 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
657 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 
1116 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.63 
 
 
498 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.59 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.517717  normal  0.0153359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  36.36 
 
 
345 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  41.94 
 
 
425 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.01 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0837451  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  32.03 
 
 
165 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.3 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  30.16 
 
 
376 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  30.16 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  32.95 
 
 
205 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0817  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.1 
 
 
491 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.38 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  30.36 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  28.77 
 
 
375 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
196 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 
351 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  33.33 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.62 
 
 
57 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  45.83 
 
 
58 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13340  4Fe-4S protein  27.85 
 
 
384 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  35.71 
 
 
502 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  34.43 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
393 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0541  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  36.84 
 
 
87 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  35.09 
 
 
507 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4350  ferredoxin  42.22 
 
 
116 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.320547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
713 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.5 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.47 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1923  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  34.55 
 
 
96 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3017  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.18 
 
 
57 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0212727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
112 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177023  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0305  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
404 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.84 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.21 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 
652 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.22 
 
 
680 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2882  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.24 
 
 
56 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000541835  normal  0.0204566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.51 
 
 
58 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.46 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.24 
 
 
57 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.19 
 
 
57 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00930  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  31.18 
 
 
199 aa  43.5  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  48.89 
 
 
60 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.241383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.26 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  43.9 
 
 
508 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0132  ferredoxin  46.51 
 
 
58 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.862186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  30.88 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 
57 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2810  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
112 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.79 
 
 
175 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.34 
 
 
672 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.39 
 
 
439 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1328  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.58 
 
 
1007 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.66 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  44.44 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  30.5 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
62 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
58 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  39.53 
 
 
378 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  44.44 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 
56 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 
1480 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  42.86 
 
 
375 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3118  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.25 
 
 
674 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>