99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0817 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0817  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1008    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  70.93 
 
 
498 aa  761    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.41 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.41 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.91 
 
 
553 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.91 
 
 
553 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24680  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain G-like protein  31.3 
 
 
251 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.63 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.91 
 
 
687 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2078  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.24 
 
 
561 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.91 
 
 
699 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0845  ferredoxin  25.68 
 
 
272 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0485504  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  24.72 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  21.79 
 
 
558 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.23 
 
 
710 aa  54.3  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241715  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.06 
 
 
672 aa  53.5  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0824  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.47 
 
 
557 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.31 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2376  putative ferredoxin protein  25.4 
 
 
719 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847567  hitchhiker  0.00764754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.88 
 
 
559 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3264  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.67 
 
 
697 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.73 
 
 
553 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.45 
 
 
553 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.45 
 
 
553 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0539  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.17 
 
 
568 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.289603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.07 
 
 
368 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.2 
 
 
696 aa  50.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  27.51 
 
 
726 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.17 
 
 
553 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 
713 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.22 
 
 
563 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  40.62 
 
 
510 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  19.38 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  40.62 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  23.79 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  35.48 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.31 
 
 
369 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.13 
 
 
695 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.56 
 
 
558 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.45 
 
 
547 aa  47.4  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  27.27 
 
 
707 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1275  ferredoxin  24.87 
 
 
270 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.15 
 
 
545 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.66 
 
 
560 aa  47  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.41 
 
 
180 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.16 
 
 
670 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25 
 
 
180 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.68 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.62 
 
 
717 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1691  anaerobic sulfite reductase, subunit C  34.78 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0354563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.84 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  32.14 
 
 
193 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.67 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.06 
 
 
510 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1425  anaerobic sulfite reductase, subunit C  36.23 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25 
 
 
180 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.86 
 
 
557 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181742  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1285  iron-sulfur cluster-binding domain protein, putative ferridoxin  21.63 
 
 
550 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
1015 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  30 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.61 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  35.09 
 
 
134 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
193 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
200 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.23 
 
 
893 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  24.41 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
193 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  24.41 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.3 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.71 
 
 
1487 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.12 
 
 
995 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  29.76 
 
 
202 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  29.17 
 
 
307 aa  43.9  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  37.5 
 
 
322 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.17 
 
 
566 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
62 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  39.62 
 
 
527 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  30.95 
 
 
194 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  26.09 
 
 
659 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.62 
 
 
180 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0754  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.48 
 
 
557 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0275  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.86 
 
 
557 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.380935  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  29.76 
 
 
218 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
210 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  24.41 
 
 
180 aa  43.5  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  29.76 
 
 
218 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.88 
 
 
988 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
215 aa  43.5  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.09 
 
 
989 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>