94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0609 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0817  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.93 
 
 
491 aa  743    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
498 aa  1019    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.88 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0539  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.33 
 
 
568 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.289603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.85 
 
 
553 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.85 
 
 
553 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  20.28 
 
 
558 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24680  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain G-like protein  27.03 
 
 
251 aa  60.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.25 
 
 
553 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.75 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.73 
 
 
553 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0824  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.59 
 
 
557 aa  57.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.89 
 
 
553 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19.89 
 
 
553 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.89 
 
 
553 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2078  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.05 
 
 
561 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.44 
 
 
553 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.45 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.13 
 
 
547 aa  54.7  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0275  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.67 
 
 
557 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.380935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.93 
 
 
557 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2376  putative ferredoxin protein  24.29 
 
 
719 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847567  hitchhiker  0.00764754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
893 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.44 
 
 
672 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0845  ferredoxin  24.62 
 
 
272 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0485504  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1275  ferredoxin  25 
 
 
270 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.21 
 
 
558 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1379  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.89 
 
 
557 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 
368 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  22.58 
 
 
553 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0754  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  21.32 
 
 
557 aa  50.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  28.8 
 
 
726 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.29 
 
 
710 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241715  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.89 
 
 
719 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.48 
 
 
696 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.75 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.43 
 
 
665 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  20.43 
 
 
707 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.57 
 
 
687 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  23.63 
 
 
284 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.6 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  40 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 
298 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  40 
 
 
510 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0679  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  19.71 
 
 
717 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1285  iron-sulfur cluster-binding domain protein, putative ferridoxin  21.16 
 
 
550 aa  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
1015 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  34.94 
 
 
307 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.39 
 
 
559 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.43 
 
 
995 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.68 
 
 
924 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.89 
 
 
719 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.900758  normal  0.200774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.44 
 
 
180 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  20.88 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.92 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.63 
 
 
900 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.57 
 
 
1487 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.29 
 
 
699 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.26 
 
 
545 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  38.46 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.63 
 
 
560 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  19.66 
 
 
580 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.1 
 
 
946 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  29.92 
 
 
193 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0413  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.4 
 
 
665 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295225  normal  0.166033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1691  anaerobic sulfite reductase, subunit C  32.81 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0354563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2303  hydrogenase, Fe-only  25.79 
 
 
562 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  22.66 
 
 
180 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  33.87 
 
 
503 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1425  anaerobic sulfite reductase, subunit C  32.81 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0381  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.55 
 
 
679 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.46 
 
 
510 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.41 
 
 
286 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.24 
 
 
552 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.09 
 
 
675 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  30.71 
 
 
659 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  25 
 
 
181 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  22.66 
 
 
180 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3264  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.5 
 
 
697 aa  43.5  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  23.44 
 
 
180 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.37 
 
 
956 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  35.71 
 
 
322 aa  43.5  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  34 
 
 
367 aa  43.5  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>