More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0897 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  36.52 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  40.3 
 
 		 396 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  36.29 
 
 		 451 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  35.32 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  34.72 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  31.45 
 
 		 376 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  33.96 
 
 		 375 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  32.99 
 
 		 382 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  31.01 
 
 		 398 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  31.1 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  33.58 
 
 		 376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  32.26 
 
 		 398 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  30.53 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  36.53 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  34.46 
 
 		 378 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  37.25 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  36.2 
 
 		 323 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  29.96 
 
 		 375 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  34.43 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.26 
 
 		 384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  34.57 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  32.69 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  32.28 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  29.43 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  31.73 
 
 		 382 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  33.48 
 
 		 323 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.13 
 
 		 382 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  31.85 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  38.69 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  38.69 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  38.55 
 
 		 320 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  31.5 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  39.05 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  35.6 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  37.93 
 
 		 316 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  29.39 
 
 		 382 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  33.7 
 
 		 328 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  34.09 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  35.86 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  29.55 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  32.24 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.17 
 
 		 618 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  31.69 
 
 		 433 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  29.41 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.54 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  28.45 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  32.03 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  30.4 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  28.1 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  29.69 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1797  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  33.02 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.549394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  27.56 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0324  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit gamma/delta  32.08 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.56 
 
 		 360 aa  52.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  28.68 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  27.91 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.91 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.15 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2345  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 1143 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.932515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  28.92 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.544476  normal  0.369186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 612 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0837451  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  43.75 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.517717  normal  0.0153359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  28.68 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.62 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  42.19 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 167 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 163 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 167 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 167 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1060  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 129 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.768979  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  42.19 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 		 519 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  44.64 
 
 		 169 aa  49.3  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  26.89 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 		 161 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3732  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 743 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.62401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 163 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  42.19 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 164 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 164 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 162 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.77 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  27.59 
 
 		 347 aa  48.9  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 164 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  46.81 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  24.59 
 
 		 332 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>