178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0494 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 376 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  76.34 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  71.39 
 
 		 375 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  64.88 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  64.08 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  55.76 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  55.73 
 
 		 375 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  50.8 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  40.94 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  41.83 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  38.16 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  37.53 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  39.05 
 
 		 382 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  38.4 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  36.97 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  36.83 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  38.74 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  37.57 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  34.46 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  34.84 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  38.49 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  38.87 
 
 		 318 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  38.16 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  32.65 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  36.75 
 
 		 323 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  37.29 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.63 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  39.4 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  36.18 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  35.74 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  33.68 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  35.16 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  31.23 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  33.09 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  33.09 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  39.44 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  36.99 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  27.64 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.08 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  33.21 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  32.39 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 		 618 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  32.95 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  32.87 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  31.69 
 
 		 306 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  29.57 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  29.62 
 
 		 441 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  30.84 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  28.37 
 
 		 307 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  28.63 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  27.76 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.24 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  31.4 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  28.8 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  28.4 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  26.64 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  33.65 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  30.67 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.02 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  30.25 
 
 		 293 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  27.34 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  28.07 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  25.91 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  28.75 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.88 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  29.95 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  22.22 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  26.05 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25.78 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  32.23 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  25.87 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.31 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  25.5 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  25.5 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.3 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  33.02 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 131 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.02 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  29.14 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  44.07 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.12 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  26.64 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3796  hypothetical protein  34.21 
 
 		 517 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0524079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  46.15 
 
 		 102 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  34.29 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  50 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1608  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 		 61 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.55229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  21.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  31.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.941505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>