74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1870 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
301 aa  591  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  55.88 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  56.15 
 
 
330 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  45.79 
 
 
303 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  45.48 
 
 
316 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  47.22 
 
 
348 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  33.99 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  32.8 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  32.48 
 
 
319 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  31.37 
 
 
318 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  30.92 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  29.77 
 
 
315 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.88 
 
 
451 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  32.78 
 
 
375 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.12 
 
 
382 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  31.31 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  39.09 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  34.58 
 
 
398 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  39.64 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  34.84 
 
 
320 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  39.05 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  39.05 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  29.87 
 
 
398 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  28.62 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  32.8 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  34.89 
 
 
375 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  34.26 
 
 
376 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  29.93 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  33.9 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  29.92 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  33.2 
 
 
379 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  29.64 
 
 
379 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  30.07 
 
 
377 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  33.08 
 
 
379 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.42 
 
 
384 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
618 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  32.24 
 
 
382 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  31.25 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  28.03 
 
 
378 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  26.73 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  28.91 
 
 
382 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  27.44 
 
 
371 aa  92.4  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.45 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  24.68 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.25 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  25.19 
 
 
505 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  29.6 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.29 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.07 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  28.14 
 
 
433 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.09 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  26.25 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  29.15 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  28.15 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  27.01 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  26.58 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  26.42 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  26.02 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  25.73 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  28.71 
 
 
326 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  23.5 
 
 
301 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  30.09 
 
 
332 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.9 
 
 
263 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  28 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  27.31 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  28.02 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  27.71 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  22.18 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  26.76 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  27.48 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>