79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3962 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  97.27 
 
 
293 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  69.39 
 
 
294 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  68.94 
 
 
293 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  51.97 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  46.43 
 
 
306 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  41.33 
 
 
332 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  39.22 
 
 
306 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  42.21 
 
 
282 aa  179  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  38.49 
 
 
309 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  39.1 
 
 
326 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  30.82 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  35.42 
 
 
479 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  35.48 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.17 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  31.48 
 
 
392 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  31.43 
 
 
398 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  29.56 
 
 
377 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  31.43 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  27.65 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  26.56 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  28.63 
 
 
398 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  27.5 
 
 
375 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  29.96 
 
 
377 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.78 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  30.04 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  29.03 
 
 
382 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.28 
 
 
347 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  28.67 
 
 
379 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  29.07 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  30.54 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  27.94 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  27 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  29.05 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  32.14 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  27.62 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  30.31 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  27.98 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  29.66 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  24.59 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  26.07 
 
 
376 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  24.59 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  27.27 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  27.62 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  27.87 
 
 
375 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.85 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  25.18 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.44 
 
 
618 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  28.44 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  25.19 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  26.14 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  25.95 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  25.98 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  27.38 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  28.51 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  30.13 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  23.84 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.54 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  27.31 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.81 
 
 
505 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.9 
 
 
442 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  27.78 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  26.17 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  24.9 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.05 
 
 
333 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  27.91 
 
 
261 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  24.62 
 
 
375 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  26.51 
 
 
433 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  32.14 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  24.61 
 
 
375 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  24.43 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  21.3 
 
 
308 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0766  hypothetical protein  38.55 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  20 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>