78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1330 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  40.36 
 
 
479 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  38.72 
 
 
332 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  30.82 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  30.47 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.74 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  30.15 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  31.08 
 
 
309 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  30.52 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  29.23 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  33.2 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  30.74 
 
 
282 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.57 
 
 
326 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  31.08 
 
 
451 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  29.96 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  27.31 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  30.97 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  27.91 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  26.74 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  27.5 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  30.2 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  27.3 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  27.03 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.63 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  28.51 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  28.9 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  26.69 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  29.13 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  28.9 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  30.99 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  26.56 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.8 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  25.89 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  26.28 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.97 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  26.95 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  24.62 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  25.09 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25.78 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  25.99 
 
 
382 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  26.92 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  23.75 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  24.38 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  27.05 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.58 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  27.31 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  24.72 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  28.11 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  23.79 
 
 
373 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  23.79 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  24.59 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  28.38 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  22.66 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.24 
 
 
442 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  26.47 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  24.03 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  24.29 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  33.85 
 
 
427 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  24.61 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  23.03 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.52 
 
 
263 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  24.59 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  24.59 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  27.71 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  24.39 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.89 
 
 
618 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  23.56 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  25.3 
 
 
375 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1595  hypothetical protein  26.36 
 
 
265 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  27.81 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  27.07 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  22.85 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  24.42 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  22.75 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>