60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2517 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  54.07 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  43.53 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  29.03 
 
 		 360 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.98 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  30.04 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  28.14 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  25.88 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  24.7 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000563569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.07 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1028  hypothetical protein  29.8 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0274639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0911  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  28.77 
 
 		 375 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  28.08 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  24.1 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.4 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.72 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  36.22 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  25.97 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 		 618 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.64 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  29.78 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  27.96 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  27.69 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  27.35 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  29.48 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  24.6 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  24.18 
 
 		 379 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  26.53 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  27.57 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.59 
 
 		 442 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  25.48 
 
 		 398 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  27.9 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  24.42 
 
 		 382 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  32.52 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  30.51 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  30.51 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  29.86 
 
 		 398 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  26.47 
 
 		 382 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  32.52 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  23.95 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  24.72 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25.74 
 
 		 479 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  29.66 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  25.81 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  21.19 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  23.04 
 
 		 376 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  25.7 
 
 		 392 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  25.31 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.91 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1843  hypothetical protein  29.3 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.222841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.83 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  30.33 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  32.52 
 
 		 505 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>