64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3647 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
377 aa  787    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  48.15 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  47.25 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  46.98 
 
 
375 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0766  hypothetical protein  24.65 
 
 
303 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4450  hypothetical protein  24.65 
 
 
300 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  hitchhiker  0.000344638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  36.6 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  25.08 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  24.11 
 
 
331 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  29.82 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  28.74 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  24.26 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.01 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.19 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  25.78 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  34.07 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  25.09 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  23.78 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  30.2 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  26.4 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  30.83 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  32.03 
 
 
309 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  30.53 
 
 
398 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  29.63 
 
 
451 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  29.32 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  23.53 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  28.99 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  31.91 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  23.29 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  23.28 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  24.57 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  26.85 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.54 
 
 
618 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  23.28 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  27.97 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  24.6 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  24.61 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.91 
 
 
306 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  26.77 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  28.77 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.61 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  22.9 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.98 
 
 
441 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  23.37 
 
 
293 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  22.8 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  24.83 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  25.2 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  23.81 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  23.03 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  25.35 
 
 
326 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  27.34 
 
 
308 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  26.76 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  24.71 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  41.07 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  25.81 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  21.9 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  27.59 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  21.9 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  27.68 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.65 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  25.93 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  24.07 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  25.21 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  20.59 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>