72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0802 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  54.07 
 
 
263 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  40.73 
 
 
261 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  31.35 
 
 
441 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.94 
 
 
347 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  30.16 
 
 
360 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  26.4 
 
 
301 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  27.39 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  32.03 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  30 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  26 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  24.52 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  31.22 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  29.67 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  27.31 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  26.42 
 
 
378 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  27.73 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  23.83 
 
 
379 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  28.18 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  26.59 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  25.51 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
618 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.38 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  29.52 
 
 
392 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  24.89 
 
 
382 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  28.51 
 
 
451 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_900  hypothetical protein  27.07 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000563569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  27.8 
 
 
332 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  28.14 
 
 
379 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  27.76 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  29.64 
 
 
378 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  28.74 
 
 
378 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002936  DET1028  hypothetical protein  27.19 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0274639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  26.41 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.76 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  25.76 
 
 
385 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  27.24 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  26.89 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0911  hypothetical protein  26.75 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  20.48 
 
 
331 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  26 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  24.38 
 
 
371 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  26.23 
 
 
376 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  26.58 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  30.77 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  27.63 
 
 
442 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  27.98 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  26.43 
 
 
375 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  25.54 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  27.2 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  23.85 
 
 
377 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  25.95 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  25.95 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  31.9 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  24.89 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  30.53 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  26.41 
 
 
376 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  32.14 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  27.49 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  25.5 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  26.18 
 
 
383 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1843  hypothetical protein  28.51 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.222841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  25.42 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  27.27 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  23.72 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  23.69 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.68 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  31.82 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  25.68 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  25.66 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  24.23 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
479 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>