77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1308 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  51.83 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  44.59 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  29.8 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  29.85 
 
 		 441 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25.38 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  26.43 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  29.64 
 
 		 347 aa  86.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  27.21 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  26.81 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  23.29 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  24.3 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  25.37 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  26.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  26.37 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  25.98 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.14 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  27.27 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  30.12 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  30.12 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  25.53 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  24.03 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.91 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  27.17 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  27.88 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  28.17 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  21.81 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.9 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  26.03 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  24.82 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.09 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  26.72 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  24.71 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  26.03 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  24.91 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  23.42 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  25.11 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.27 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  23.64 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  27.56 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  25.57 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  27.49 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  25.11 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  24.09 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  23.64 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  25.09 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  25.58 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  20.66 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  24.44 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  22.98 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  59.09 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  22.33 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  22.53 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  25.1 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  23.75 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.46 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  25.85 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  26.77 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  22.93 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  27.5 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  24.03 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  27.5 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  23.58 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  23.91 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  22.32 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  23.5 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  23.08 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  27.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  27.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  27.74 
 
 		 427 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  23.66 
 
 		 479 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  25.38 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  23.08 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  20.61 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>