107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2519 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  781    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  33.42 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  35.46 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  32.1 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  31.03 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  33.85 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  34.73 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  32.28 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.86 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  32.71 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  31.25 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  30.34 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  35.17 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  31.02 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  32.03 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  35.16 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  31.63 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.49 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  32.94 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  31.64 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  31.4 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  33.14 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  30.95 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  30.85 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  30.7 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  29.69 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  32.99 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  31.97 
 
 		 323 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  27.87 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  31.61 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  34.22 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  31.08 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  31 
 
 		 319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  31 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  27.72 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  29.39 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  29.39 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  28.63 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.21 
 
 		 618 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  30.67 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  32.45 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  28.91 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  26.79 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  25.26 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.9 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  28.08 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.81 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  26.44 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  23.98 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  26.12 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  26.6 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  26.12 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.38 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25.07 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.04 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  25.71 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  25.98 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  25.86 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  24.89 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  26.47 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  24.38 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.57 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.09 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  25.64 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.11 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  22.56 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  24.03 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  28.77 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.6 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  23.92 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  26.15 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  26.15 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  29.93 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  21.19 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  37.93 
 
 		 624 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 		 154 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 		 485 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  40.68 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.72 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 1116 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.32 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  24.76 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 		 623 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 627 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 519 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  41.07 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3193  electron transport complex protein rnfB  38.71 
 
 		 188 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3932  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.71 
 
 		 188 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.66 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.15 
 
 		 752 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 596 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.29 
 
 		 762 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 		 596 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.66 
 
 		 439 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  40.68 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>