77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2714 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
326 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  49.53 
 
 
306 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  37.89 
 
 
304 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  37.04 
 
 
306 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  35.95 
 
 
309 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  39.18 
 
 
293 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  38.78 
 
 
293 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  35.27 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  39.39 
 
 
293 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  35.74 
 
 
332 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  38.26 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  34.67 
 
 
479 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  29.57 
 
 
332 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  32.6 
 
 
398 aa  99.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.8 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  27.67 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  29.82 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  29.13 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  29.49 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  29.15 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  27.95 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  23.86 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  25.33 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  27.17 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  26.99 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  27.85 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  29.2 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.05 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  28.07 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  28.45 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  29.05 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  29.22 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  29.22 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.09 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  25.19 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  30.87 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  26.99 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  25.11 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  26.48 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  24.74 
 
 
433 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  27.92 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  26.48 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  26.72 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  21.15 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  25.61 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  29.51 
 
 
385 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.18 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.93 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  26.25 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  24.5 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  29.61 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  24.2 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  24.37 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.83 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  26.47 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  21.9 
 
 
378 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.11 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  27.87 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  22.71 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  25.71 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.57 
 
 
263 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  28.71 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  28.23 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  24.08 
 
 
505 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  27.72 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  28.99 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  23.57 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  25.35 
 
 
377 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  23.57 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  24.78 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1799  hypothetical protein  28.17 
 
 
438 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420989  normal  0.0134014 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  21.7 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  27.56 
 
 
699 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>