70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0364 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  908    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  39.22 
 
 
433 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.39 
 
 
441 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  28.14 
 
 
379 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  28.97 
 
 
377 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  30.74 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  28.51 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.19 
 
 
618 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  26.53 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  26.77 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  24.31 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  29.28 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  23.39 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25.9 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  27.08 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  23.44 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  24.61 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  24.69 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  24.91 
 
 
261 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  27.4 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  28.45 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  27.05 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  28.46 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  26.87 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  21.81 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  30.61 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  24.8 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  24.83 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  26.4 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  25.74 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  26.39 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  26.3 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.64 
 
 
373 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  31.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  25.9 
 
 
304 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 
306 aa  63.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  24.33 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  24.26 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  26.09 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  23.81 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  26.25 
 
 
301 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  23.92 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  25.39 
 
 
332 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  27.68 
 
 
323 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  25.54 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  25.54 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  25.8 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  24.32 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  24.6 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  27.39 
 
 
328 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  24.58 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  24.82 
 
 
382 aa  57.4  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  25.45 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.63 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  24.24 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  25.32 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  26.35 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  25.82 
 
 
376 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  31.01 
 
 
294 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  21.24 
 
 
308 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.59 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  24.89 
 
 
293 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  22.22 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  25.6 
 
 
382 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  22.22 
 
 
371 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  26.67 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  30.08 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  25.21 
 
 
282 aa  43.5  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  34.85 
 
 
434 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>