53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1972 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  57.24 
 
 		 301 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  44.59 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  27.2 
 
 		 378 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  26.38 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  25.78 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  25.81 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  26.1 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  26 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  24.39 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  25.52 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.34 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  23.79 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.93 
 
 		 618 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  25 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  27.04 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.1 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  24.06 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  22.68 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  23.92 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  23.36 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  23.25 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  21.59 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  22.04 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  22.55 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  22.43 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  22.53 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  21.24 
 
 		 442 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.07 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  23.9 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  23.92 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  23.14 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  21.32 
 
 		 396 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  24.61 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  22.43 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.01 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  22.54 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  22.18 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  27.34 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  20.4 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  21.24 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  20.69 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  19.63 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  22.85 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  20.08 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  21.67 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  21.98 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  23.77 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  20.91 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  22.62 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  21.29 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>