80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2128 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  914    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  31.36 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  28.39 
 
 
442 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  36.5 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  30.74 
 
 
379 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 
618 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  32.63 
 
 
373 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  28.91 
 
 
377 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  31.62 
 
 
379 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  25.63 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  26.3 
 
 
398 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  29.85 
 
 
307 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  31.54 
 
 
261 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  31.35 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  27.64 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.02 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  27.38 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  28.03 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  27.45 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.44 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  28.16 
 
 
505 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  27.92 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  29.78 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  26.92 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  25.72 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  29.62 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  24.5 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  27.52 
 
 
318 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  27.2 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  28.4 
 
 
376 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  27.55 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  26.47 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  24.91 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  26.64 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  28.95 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  26.5 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  26.84 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  25.34 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  25.09 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  26.43 
 
 
293 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  26.56 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.78 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  24.7 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.4 
 
 
263 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  22.52 
 
 
301 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  25.99 
 
 
293 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  27.52 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  27.44 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  27.05 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  27.91 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  26.44 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  26.33 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  25.83 
 
 
294 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  26.1 
 
 
332 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  23.25 
 
 
308 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  29.02 
 
 
333 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  29.02 
 
 
318 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  26.22 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  25.53 
 
 
348 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.03 
 
 
261 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.03 
 
 
261 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  24.48 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  27.11 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  27.47 
 
 
306 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  25.11 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  28.97 
 
 
427 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  24.64 
 
 
309 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  27.2 
 
 
306 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  25.87 
 
 
306 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  26.98 
 
 
377 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  22.75 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  27 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  26.85 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  26.85 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  26.99 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  42.5 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2462  hypothetical protein  27.72 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>