237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0471 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  100 
 
 		 378 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  96.56 
 
 		 378 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  66.67 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  64.52 
 
 		 376 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  64.11 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  53.39 
 
 		 451 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  52.55 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  53.08 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  42.38 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  41.25 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  35.7 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  39.43 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  36.22 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  37.1 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  39.39 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  35.86 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.9 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  34.41 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  34.91 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  38.62 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  35.88 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  34.58 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  38.08 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  38.41 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  37.29 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  33.77 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  37.05 
 
 		 319 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  37.05 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  35.86 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  33.16 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  30.71 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.45 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  28.27 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  34.57 
 
 		 261 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  34.57 
 
 		 261 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  31.9 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  33.84 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  32.06 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  32.93 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  27.91 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  30.24 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  29.19 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 		 618 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 		 331 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  31.98 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  31.78 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  32.22 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.51 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  28.77 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  27.73 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25.77 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  28.9 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  30.99 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.47 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.53 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.15 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  23.84 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  26.1 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  27.48 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  27.78 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.22 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  25.81 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  22.81 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  28.4 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  30.24 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  24.09 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  29.64 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  25.09 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  27.96 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.96 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  25.09 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25.58 
 
 		 479 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  23.66 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  24.6 
 
 		 505 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  35.48 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  40.98 
 
 		 102 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  39.39 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  25.63 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 95 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.753376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 596 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.51 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  32.98 
 
 		 187 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  35.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  35.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  35.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  25.11 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  35.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 131 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0875  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  39.29 
 
 		 99 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000569168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>