80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2108 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  38.72 
 
 
332 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  36.99 
 
 
479 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  40.21 
 
 
304 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  42.12 
 
 
293 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  41.33 
 
 
293 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  40.15 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  40.59 
 
 
293 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  35.44 
 
 
306 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  36.86 
 
 
309 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  36.92 
 
 
306 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  34.1 
 
 
282 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  35.74 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  33.72 
 
 
398 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  31.13 
 
 
379 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  31.56 
 
 
382 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  35.1 
 
 
385 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  31.67 
 
 
398 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  30.83 
 
 
377 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  29.75 
 
 
347 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  31.01 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  30.16 
 
 
377 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  31.05 
 
 
451 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  32.92 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  30.29 
 
 
378 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  29.22 
 
 
382 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  31.78 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  31.43 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  26.36 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  22.82 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  26.91 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  26.45 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  27.38 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  26.74 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  28.93 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  28.94 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  26.79 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  28.77 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  29.27 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  24.7 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  28.14 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.56 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  29.23 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  25.78 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  29.44 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  22.05 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  26.78 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  26.78 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  26.34 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.16 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  23.97 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  26.07 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  23.08 
 
 
433 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  27.44 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.8 
 
 
260 aa  62.8  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.1 
 
 
441 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  26.22 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.39 
 
 
442 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  20.66 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  37.12 
 
 
375 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  26.32 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  37.12 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25.08 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  33.06 
 
 
427 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  26.27 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.53 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
373 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  52.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  25.41 
 
 
505 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  30.09 
 
 
301 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  25.42 
 
 
396 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  19.75 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  25.99 
 
 
306 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  23.05 
 
 
303 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  22.27 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  24.59 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  28.19 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  25.44 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>