75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0348 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  625  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  51.82 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  52.3 
 
 
293 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  55.3 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  51.97 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  40.21 
 
 
332 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  40.85 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  39.47 
 
 
309 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  40.06 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  37.36 
 
 
282 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  37.89 
 
 
326 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  34.65 
 
 
479 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  29.74 
 
 
332 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  34.3 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  28.73 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  28.92 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  31.05 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  29.5 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  29.52 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  31.95 
 
 
385 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  30 
 
 
392 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  26.94 
 
 
378 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  26.17 
 
 
375 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  32.03 
 
 
396 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  27.94 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  27.38 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  25.78 
 
 
382 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  28.94 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  29.55 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  26.69 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  26.69 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  26.56 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  27.2 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  28.97 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  25.86 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  26.09 
 
 
382 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  25.4 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  28.29 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  29.21 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  25.84 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  29.15 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 
618 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  26.29 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  26.88 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  31.22 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  26.42 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  25.18 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  26.47 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  27.27 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  28.87 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  26.98 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25.74 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  25.1 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  25.7 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  29.78 
 
 
441 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.26 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  29.02 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.9 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  28.95 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.94 
 
 
505 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  29.47 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  26.42 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  25.54 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  23.08 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  22.9 
 
 
377 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  28.05 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  23.69 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  25.34 
 
 
306 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.91 
 
 
263 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  24.55 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  25.09 
 
 
396 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3444  hypothetical protein  32.97 
 
 
403 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>