68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0338 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  56.86 
 
 
301 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  51.96 
 
 
328 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  47.78 
 
 
303 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  45.09 
 
 
316 aa  228  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  46.3 
 
 
348 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  33.23 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  33.22 
 
 
319 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  31.92 
 
 
315 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  32.57 
 
 
319 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  34.92 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  31.8 
 
 
318 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  32.13 
 
 
323 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.54 
 
 
451 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  31.49 
 
 
378 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  35.74 
 
 
320 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  30.52 
 
 
378 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  37.08 
 
 
396 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  32.15 
 
 
375 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  36.29 
 
 
398 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  31.75 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  36.28 
 
 
376 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  29.77 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  32.17 
 
 
382 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  33.79 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  31.65 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  32.01 
 
 
377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  29.11 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  30.04 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.46 
 
 
618 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  28.62 
 
 
375 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  30.72 
 
 
382 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  32.65 
 
 
379 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  31.03 
 
 
377 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.4 
 
 
385 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  25.94 
 
 
378 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  29.17 
 
 
382 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  30.94 
 
 
379 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  31.3 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  24.3 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.22 
 
 
441 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  25.65 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  24.54 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  24.8 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  26.55 
 
 
396 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  28.38 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.78 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  21.22 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25.79 
 
 
373 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  28.96 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  28.7 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  22.61 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  30.6 
 
 
505 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  28.05 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  24.31 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  26.38 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  26.89 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  27 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  23.08 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  27.68 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  19.43 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
358 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>