51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0562 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  100 
 
 
479 aa  968    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  40.36 
 
 
332 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  36.99 
 
 
332 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  35 
 
 
294 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  34.65 
 
 
304 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  35.83 
 
 
293 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  35.42 
 
 
293 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  33.58 
 
 
306 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  37.44 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  33.2 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  30.22 
 
 
282 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  31.05 
 
 
309 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  28.7 
 
 
306 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  30.56 
 
 
347 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  30.52 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  25.33 
 
 
376 aa  73.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  28.82 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  27.04 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  25.38 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  25.71 
 
 
318 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  24.89 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  22.67 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  32.28 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  25.97 
 
 
377 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  22.75 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  24.27 
 
 
376 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  26.89 
 
 
382 aa  60.1  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  24.55 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  23.89 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  25.58 
 
 
378 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  25.58 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  24.76 
 
 
379 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  26.15 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  30.29 
 
 
316 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  24.03 
 
 
382 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  21.15 
 
 
382 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  24.41 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  23.29 
 
 
378 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  25.55 
 
 
379 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  23.08 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  25.73 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.88 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.74 
 
 
263 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  28.35 
 
 
328 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  21.89 
 
 
360 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  25.33 
 
 
261 aa  46.6  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  23.66 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  24.17 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  23.75 
 
 
319 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  27.1 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>