34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1037 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  52.48 
 
 
306 aa  335  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  45.64 
 
 
358 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  40.13 
 
 
333 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  34.39 
 
 
347 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  28.28 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  29.21 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  28.18 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  26.99 
 
 
384 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  24.19 
 
 
382 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  24.51 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  27.01 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  25.27 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  23.22 
 
 
377 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  25.78 
 
 
367 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  25.97 
 
 
376 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  25.63 
 
 
378 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  24.6 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
378 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  24.54 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  30.23 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  25.81 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  24.78 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  25.34 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  28.44 
 
 
451 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  26.99 
 
 
441 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  24.32 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  24.07 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  26.64 
 
 
398 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.38 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  24.59 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  22.75 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  22.69 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>