56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1269 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  889    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  48.15 
 
 		 377 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  43.72 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  43.46 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4450  hypothetical protein  26.51 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  hitchhiker  0.000344638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0766  hypothetical protein  26.38 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  33.77 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  36.76 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  23.38 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  38.17 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  39.09 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  40.91 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  34.44 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  30.48 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  33.33 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  26.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  39.45 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  34.56 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  32.69 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  27.78 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.8 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  31.78 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  30.17 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  33.06 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  31.29 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.97 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  29.66 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.81 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  35.14 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  27.33 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  24.33 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  33.85 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  28.93 
 
 		 318 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  29.93 
 
 		 382 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  27.36 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.66 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  24.36 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  29.7 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  33.02 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  26.42 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  31.3 
 
 		 293 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  28.3 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  28.3 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  27.74 
 
 		 307 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  31.3 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  28.45 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  26.17 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  44.9 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  31.3 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.06 
 
 		 618 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  31.3 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  25.47 
 
 		 323 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  25.38 
 
 		 323 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>