58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0351 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  48.53 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  40.13 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  38.74 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  31.93 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  26.96 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  28.18 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  29.34 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  28.23 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  26.34 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  25.1 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  27.88 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  25.27 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  27.64 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.64 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  28.99 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  24.9 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  26.52 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  29.02 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  25.54 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  28.17 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  31.58 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25.97 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  27.42 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  29.73 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  28.9 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  26.58 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  25.71 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  28.14 
 
 		 433 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  27.78 
 
 		 451 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  26.83 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  23.21 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  26.94 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  25.59 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  23.72 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  26.09 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  29.01 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  25.11 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  29.03 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  23.08 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  26.44 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.62 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  23.69 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  24.39 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.64 
 
 		 618 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  24.19 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  26.38 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  26.38 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  25 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  24.09 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  24.24 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  24.64 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  25.44 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  23.41 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  26.55 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>