12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1785 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2462  hypothetical protein  66.39 
 
 		 365 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1799  hypothetical protein  27.88 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420989  normal  0.0134014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2180  hypothetical protein  26.03 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0133963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  30.26 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  27.37 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  29.01 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  30.23 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4593  hypothetical protein  21.48 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.311447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  28.19 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>