13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2462 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  66.39 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1799  hypothetical protein  28.02 
 
 		 438 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420989  normal  0.0134014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2180  hypothetical protein  27.7 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0133963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  29.71 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  30.59 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  36.08 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  29.83 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.47 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.41 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  30.07 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.72 
 
 		 441 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  34.26 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>