56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0208 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  100 
 
 		 348 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  45.59 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  47.22 
 
 		 301 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  45.77 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  45.55 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  40 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  33.96 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  33.23 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  32.41 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  33.23 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  34.06 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  31.27 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  29.5 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  30.15 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  29.01 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  29.19 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  30.31 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  30.36 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  29.89 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  32.65 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  29.39 
 
 		 377 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  29.59 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  32.87 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  29.94 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  31.3 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  26.33 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.5 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  30.89 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.24 
 
 		 261 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.24 
 
 		 261 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  28.28 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  30.5 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  29.63 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.69 
 
 		 618 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  28.47 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  30.07 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  28.31 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  25.66 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.79 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.29 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  23.44 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  25.51 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  24.73 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  23.5 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  30 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  27.69 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  24.43 
 
 		 306 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  25.62 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  25.62 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  25.38 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>