90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2625 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.52 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.6 
 
 
135 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.63 
 
 
111 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.41 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.19 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.46 
 
 
109 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  54.74 
 
 
106 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  41.96 
 
 
111 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.64 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  45.65 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  36.89 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.27 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.03 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
75 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3749  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.67 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
560 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.81 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.612108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  38.78 
 
 
502 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
559 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31.48 
 
 
265 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2420  ferredoxin family protein  43.1 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.498162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.71 
 
 
672 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.14 
 
 
553 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  30.65 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 
590 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 
840 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  34.69 
 
 
500 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  34.69 
 
 
500 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.37 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0584477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.93 
 
 
559 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.36 
 
 
563 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  36.17 
 
 
500 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 
580 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.85 
 
 
481 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00295225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  40 
 
 
436 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.62 
 
 
597 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
80 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  30.36 
 
 
558 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1771  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain B  36.67 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  32.69 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  32.69 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  32.69 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 
481 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  34.62 
 
 
313 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.65 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  23.68 
 
 
231 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1528  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.546618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.12 
 
 
278 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.85 
 
 
481 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
596 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.82 
 
 
566 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1492  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.71 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229965  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
626 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 
582 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
626 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1238  pyruvate synthase, gamma subunit  36.62 
 
 
310 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
947 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.943439  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
307 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  26.87 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.67 
 
 
752 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  34.09 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  26.42 
 
 
310 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3321  ferredoxin family protein  39.66 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  31.03 
 
 
510 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  41.18 
 
 
161 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38 
 
 
810 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
169 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  29.51 
 
 
198 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  29.51 
 
 
194 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  32.76 
 
 
604 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>