43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3288 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  50 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.82 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.62 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.27 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 		 98 aa  103  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  46.07 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  50 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.59 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.65 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.65 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.28 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.68 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 563 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 		 840 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000173752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 559 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 		 687 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 699 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  44.29 
 
 		 726 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  35.71 
 
 		 436 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 73 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.99 
 
 		 272 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  30 
 
 		 376 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  40.74 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.68 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 		 485 aa  40.8  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  32.2 
 
 		 580 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 		 695 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 553 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0901  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.76 
 
 		 344 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>