55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2899 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  100 
 
 
272 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  59.19 
 
 
276 aa  333  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  57.72 
 
 
276 aa  333  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  57.04 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  57.14 
 
 
275 aa  317  9e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  47.08 
 
 
267 aa  259  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.13 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  39.34 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  34.52 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  31.64 
 
 
265 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  32.97 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  28.43 
 
 
320 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  32.86 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  41.51 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  33.72 
 
 
262 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  31.1 
 
 
262 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  30.11 
 
 
247 aa  122  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  31.33 
 
 
249 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  32.06 
 
 
262 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  43.79 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  42.48 
 
 
180 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  29.96 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  32.95 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  42.48 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  43.79 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  40.51 
 
 
221 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  31.1 
 
 
259 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  44.29 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  29.02 
 
 
305 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  29.81 
 
 
360 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  36.31 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  28.38 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 
350 aa  89.7  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  33.33 
 
 
318 aa  88.6  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  36.14 
 
 
333 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  28.64 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  25.43 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  26.73 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 
65 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1467  iron-sulfur cluster-binding protein  43.75 
 
 
64 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0638902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1361  Iron-sulfur cluster-binding protein  43.75 
 
 
64 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385025  hitchhiker  0.00000000000102119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0901  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 
64 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.33 
 
 
64 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.44 
 
 
82 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.25 
 
 
432 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1326  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 
64 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000117885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.14 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.14 
 
 
159 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
77 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  25.85 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  40 
 
 
133 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  36.99 
 
 
125 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  30.49 
 
 
345 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>