72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3156 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  273  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.6 
 
 
135 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  80.6 
 
 
135 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.6 
 
 
135 aa  226  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.32 
 
 
111 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  54.9 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.51 
 
 
109 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.12 
 
 
118 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  49.47 
 
 
111 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.25 
 
 
107 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  48.62 
 
 
106 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  38.74 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  44.09 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.62 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.55 
 
 
560 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  28.95 
 
 
265 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  45.1 
 
 
500 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3749  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.68 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  45.1 
 
 
500 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
840 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  29.11 
 
 
580 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  35.71 
 
 
161 aa  43.9  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.1 
 
 
500 aa  43.9  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  37.93 
 
 
450 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
563 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  40 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  40 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  35.59 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  37.93 
 
 
414 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.47 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
559 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.38 
 
 
439 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  36.36 
 
 
158 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  36.36 
 
 
158 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.36 
 
 
553 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.36 
 
 
553 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0200589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1492  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.71 
 
 
247 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229965  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
502 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.612108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  34.55 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  34.29 
 
 
272 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.27 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.03 
 
 
672 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  35.09 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
558 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  30.77 
 
 
586 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1238  pyruvate synthase, gamma subunit  35.59 
 
 
310 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  30.65 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
398 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  28.36 
 
 
538 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 
481 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  28.04 
 
 
275 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1528  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.546618  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  31.65 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.69 
 
 
566 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.17 
 
 
113 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0990829  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.53 
 
 
238 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0450  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.35 
 
 
215 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  37.04 
 
 
503 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  31.15 
 
 
168 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
559 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>