219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1383 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  79.49 
 
 		 160 aa  270  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  78.21 
 
 		 160 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  78.21 
 
 		 160 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  78.85 
 
 		 160 aa  264  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  76.4 
 
 		 161 aa  261  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  77.85 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  77.85 
 
 		 158 aa  258  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  72.67 
 
 		 161 aa  249  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  67.31 
 
 		 159 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  61.78 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  63.06 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  61.54 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  63.69 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  62.75 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  61.78 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  48.73 
 
 		 161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  47.47 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  45.62 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  45.34 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  45.62 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  45 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  45 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  45 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  45 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  45 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  45 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  45 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  49.68 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  44.38 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  47.2 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  44.3 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  43.67 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  44.59 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  42.86 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  42.86 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  42.86 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  42.21 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  41.18 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  40.62 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  40 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  42.21 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  41.56 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  40.14 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  36.02 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  41.22 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.3 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  36.2 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  32.69 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  34.36 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.79 
 
 		 179 aa  84  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.01 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  28.66 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  32.64 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.97 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.25 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.26 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.09 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  30.28 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  30.28 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.91 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  26.74 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  28.95 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  29.14 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  29.09 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.11 
 
 		 538 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.87 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.24 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.52 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.36 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.36 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.74 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.88 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.72 
 
 		 524 aa  57.8  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.98 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.28 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.76 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.21 
 
 		 519 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.81 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.4 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.25 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.82 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.38 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0389498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>