223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1481 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  100 
 
 
160 aa  330  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  98.12 
 
 
160 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  97.5 
 
 
160 aa  322  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  96.25 
 
 
160 aa  315  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  78.21 
 
 
168 aa  267  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  73.75 
 
 
161 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  75.16 
 
 
161 aa  254  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  75.16 
 
 
158 aa  253  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  75.16 
 
 
158 aa  253  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  67.53 
 
 
159 aa  222  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  62.66 
 
 
158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  64.38 
 
 
161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  60.87 
 
 
161 aa  213  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  64.71 
 
 
163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  63.4 
 
 
162 aa  209  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  62.5 
 
 
165 aa  197  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  49.06 
 
 
161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  49.06 
 
 
161 aa  161  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  44.79 
 
 
172 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  46.1 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  47.17 
 
 
178 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  45.91 
 
 
178 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  46.79 
 
 
168 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  45.45 
 
 
164 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  45.45 
 
 
164 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  45.45 
 
 
164 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  47.1 
 
 
165 aa  147  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  49.68 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  45.45 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  45.45 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  44.81 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  44.81 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  44.81 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  43.12 
 
 
167 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  43.12 
 
 
167 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  43.12 
 
 
167 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  42.48 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  41.94 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  41.94 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  41.94 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  41.94 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  41.29 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  39.88 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  43.05 
 
 
163 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  38.61 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  41.06 
 
 
163 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  42.03 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  42.28 
 
 
188 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  35.67 
 
 
160 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  37.01 
 
 
163 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  37.58 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  33.54 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.81 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.62 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  31.43 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  31.43 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  28.66 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  29.09 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.93 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.29 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.39 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.46 
 
 
221 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  32.35 
 
 
141 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.48 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32 
 
 
213 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.81 
 
 
247 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.22 
 
 
249 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.58 
 
 
211 aa  58.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.67 
 
 
470 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  30.61 
 
 
206 aa  58.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  30 
 
 
239 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.8 
 
 
213 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.72 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  28.74 
 
 
242 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.83 
 
 
246 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.19 
 
 
519 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.83 
 
 
204 aa  54.7  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.22 
 
 
246 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  28.12 
 
 
234 aa  54.3  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 
250 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  28.22 
 
 
270 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.85 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.663075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.78 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  25.48 
 
 
250 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  26.32 
 
 
244 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.85 
 
 
331 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  29.25 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.15 
 
 
266 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  27.15 
 
 
231 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  27.15 
 
 
231 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.56 
 
 
229 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.15 
 
 
231 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.15 
 
 
231 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.45 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>