237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1432 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  100 
 
 
158 aa  320  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  72.55 
 
 
162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  69.62 
 
 
163 aa  234  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  65.82 
 
 
161 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  66.88 
 
 
161 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  64.33 
 
 
161 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  62.66 
 
 
160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  62.66 
 
 
160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  62.66 
 
 
160 aa  220  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  63.69 
 
 
158 aa  219  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  63.69 
 
 
158 aa  219  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  65.36 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  61.78 
 
 
168 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  62.03 
 
 
160 aa  216  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  57.32 
 
 
161 aa  197  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  59.24 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  53.85 
 
 
161 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  53.85 
 
 
161 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  47.8 
 
 
168 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  47.4 
 
 
165 aa  156  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  45.4 
 
 
172 aa  156  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  44.52 
 
 
164 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  44.52 
 
 
164 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  44.52 
 
 
164 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  44.52 
 
 
164 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  44.52 
 
 
164 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  43.87 
 
 
164 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  43.87 
 
 
164 aa  150  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  43.23 
 
 
178 aa  150  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  43.87 
 
 
164 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  43.87 
 
 
164 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  44.03 
 
 
167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  44.03 
 
 
167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  44.03 
 
 
167 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  43.23 
 
 
163 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  43.23 
 
 
163 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  43.23 
 
 
163 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  46.2 
 
 
159 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  40.65 
 
 
178 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  42.58 
 
 
163 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  41.03 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  41.91 
 
 
187 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  43.14 
 
 
163 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  43.14 
 
 
163 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  36.65 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  40 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  43.92 
 
 
188 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  38.06 
 
 
163 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  37.82 
 
 
160 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  38.36 
 
 
166 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.03 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  35.67 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.13 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  32.73 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  30.25 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.86 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  30.77 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  30.77 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.94 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.73 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.08 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.21 
 
 
247 aa  63.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  32.21 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.86 
 
 
209 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.19 
 
 
519 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  29.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  31.13 
 
 
221 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.29 
 
 
470 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.71 
 
 
249 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.86 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.05 
 
 
213 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
538 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  28.48 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.99 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.13 
 
 
524 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.95 
 
 
588 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 
244 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.36 
 
 
266 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.29 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  26.9 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  30.06 
 
 
263 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.06 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  27.5 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.61 
 
 
161 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.663075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.34 
 
 
591 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.07 
 
 
241 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  27.63 
 
 
219 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.95 
 
 
395 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  26.11 
 
 
250 aa  51.2  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  26.71 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 
528 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0069  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.85 
 
 
397 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.416863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  29.92 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.14 
 
 
481 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00295225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  27.39 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>