185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000511 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  93.17 
 
 
161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  61.15 
 
 
168 aa  215  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  58.06 
 
 
162 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  55.9 
 
 
172 aa  186  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  55.56 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  56.77 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  53.85 
 
 
158 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  50.96 
 
 
161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  51.61 
 
 
158 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  51.61 
 
 
158 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  47.53 
 
 
163 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  49.37 
 
 
161 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  47.53 
 
 
163 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  47.53 
 
 
163 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  47.53 
 
 
178 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  46.91 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  49.69 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  49.06 
 
 
160 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  49.06 
 
 
160 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  48.73 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  46.54 
 
 
165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  46.58 
 
 
164 aa  160  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  46.58 
 
 
164 aa  160  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  46.58 
 
 
164 aa  160  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  46.58 
 
 
164 aa  160  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  46.58 
 
 
164 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  46.58 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  46.3 
 
 
178 aa  160  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  49.06 
 
 
160 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  45.96 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  47.77 
 
 
161 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  45.96 
 
 
164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  51.43 
 
 
161 aa  158  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  45.96 
 
 
164 aa  157  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  48.43 
 
 
159 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  46.5 
 
 
159 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  52.17 
 
 
165 aa  146  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  44.44 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  40.12 
 
 
182 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  40 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  47.33 
 
 
188 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  40 
 
 
166 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  38.22 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  38.65 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  37.58 
 
 
163 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  35.62 
 
 
163 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  35.85 
 
 
160 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  35.22 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.67 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.32 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  32.1 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  36.81 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.94 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 
247 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.26 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  35.33 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
204 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.82 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.4 
 
 
588 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.56 
 
 
524 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.45 
 
 
470 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.11 
 
 
189 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  29.08 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  29.08 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.28 
 
 
192 aa  57.4  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
538 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  33.86 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.95 
 
 
519 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  30.3 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.87 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  33.76 
 
 
206 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 
229 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2501  ferredoxin-type protein NapF  52.27 
 
 
45 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.83 
 
 
266 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.1 
 
 
157 aa  52  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.41 
 
 
209 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  26.14 
 
 
221 aa  51.6  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.93 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.72 
 
 
656 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  32.56 
 
 
273 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2435  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  22.44 
 
 
267 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.78 
 
 
244 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1357  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.92 
 
 
502 aa  47.4  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.16 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.16 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  24.67 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>