37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2501 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  100 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  100 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  100 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2501  ferredoxin-type protein NapF  100 
 
 		 45 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  100 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  82.22 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  69.44 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  69.44 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  69.44 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  62.16 
 
 		 187 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  52.27 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  52.27 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  50 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  59.46 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  59.46 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  61.11 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.56 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  51.11 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  46.51 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  58.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  55.56 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.61 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  45 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  45 
 
 		 178 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  52.78 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  58.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  48.65 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  44.44 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>