189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05379 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  100 
 
 
161 aa  329  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  93.17 
 
 
161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  63.29 
 
 
168 aa  220  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  58.71 
 
 
162 aa  191  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  55.28 
 
 
172 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  54.9 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  56.13 
 
 
159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  53.85 
 
 
158 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  50.32 
 
 
161 aa  170  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  48.15 
 
 
178 aa  167  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  50.32 
 
 
158 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  50.32 
 
 
158 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  49.06 
 
 
160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  49.06 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  48.1 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  46.91 
 
 
178 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  46.91 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  46.91 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  46.91 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  48.43 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  47.47 
 
 
168 aa  160  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  50.7 
 
 
161 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  46.3 
 
 
163 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  46.54 
 
 
165 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  47.77 
 
 
161 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  47.8 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  157  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  45.34 
 
 
164 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  157  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  157  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  45.34 
 
 
164 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  44.72 
 
 
164 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  44.72 
 
 
164 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  45.86 
 
 
159 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  48.43 
 
 
159 aa  154  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  43.83 
 
 
167 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  43.83 
 
 
167 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  43.83 
 
 
167 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  51.45 
 
 
165 aa  147  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  40.74 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  38.31 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  46.98 
 
 
188 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  41.94 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  39.1 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  40.88 
 
 
170 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  37.82 
 
 
163 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  34.81 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  35.85 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.91 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  36.2 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  30.86 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.57 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.26 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.3 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.67 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  37.31 
 
 
219 aa  62  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  29.7 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  29.7 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.36 
 
 
204 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.45 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.89 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.4 
 
 
588 aa  57.8  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.19 
 
 
538 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  33.52 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.52 
 
 
524 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.37 
 
 
211 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
209 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  30.6 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.25 
 
 
470 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.73 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0979  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.83 
 
 
395 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.363777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2501  ferredoxin-type protein NapF  52.27 
 
 
45 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  25.48 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
656 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.76 
 
 
519 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.2 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.19 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.06 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.86 
 
 
266 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  30.3 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.49 
 
 
395 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0710  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.14 
 
 
252 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.696153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.77 
 
 
252 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.565926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  31.78 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.04 
 
 
504 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  28.92 
 
 
226 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0346  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  29.33 
 
 
352 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.715364  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.58 
 
 
252 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 
383 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.337966  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.87 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.06 
 
 
395 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  28.83 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.83 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.83 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>