134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4203 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  100 
 
 
163 aa  317  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  90.18 
 
 
163 aa  289  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  48.32 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  42.21 
 
 
168 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  42.58 
 
 
161 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  40.52 
 
 
158 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  40.52 
 
 
158 aa  120  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  43.14 
 
 
158 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  41.18 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  45.16 
 
 
159 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  42.42 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  41.72 
 
 
160 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  41.29 
 
 
159 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  42.48 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  39.87 
 
 
161 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  41.06 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  41.06 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  48.87 
 
 
166 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  41.06 
 
 
160 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  45.59 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  45.59 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  45.59 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  42.11 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  49.01 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  42.11 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  42.11 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  42.11 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  46.15 
 
 
165 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  42.11 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  42.11 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  42.11 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  42.11 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  39.88 
 
 
187 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  39.49 
 
 
172 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  37.97 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  41.45 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  39.13 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  37.2 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  37.58 
 
 
161 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  46.71 
 
 
188 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  37.82 
 
 
161 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  35.26 
 
 
159 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  42.96 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  42.96 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  42.96 
 
 
163 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  42.34 
 
 
161 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  42.22 
 
 
163 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  41.78 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  41.61 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  31.14 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  39.86 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.92 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.04 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  28.83 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.73 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  31.85 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.63 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.06 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.28 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  29.25 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  29.25 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.25 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.92 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  29.01 
 
 
273 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2588  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  24.86 
 
 
486 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.68 
 
 
482 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  29.53 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.64 
 
 
519 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  26.9 
 
 
436 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2501  ferredoxin-type protein NapF  59.46 
 
 
45 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.22 
 
 
538 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.53 
 
 
267 aa  47.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  30.2 
 
 
346 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  29.1 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.71 
 
 
394 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.06 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.8 
 
 
470 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
209 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.96 
 
 
791 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
524 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.36 
 
 
1480 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.32 
 
 
393 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1210  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.31 
 
 
393 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  27.13 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0634  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.47 
 
 
354 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  27.61 
 
 
265 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1545  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
553 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0994  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.47 
 
 
395 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  29.8 
 
 
242 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.69 
 
 
393 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.98 
 
 
481 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.1 
 
 
355 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.53 
 
 
211 aa  43.9  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  28.66 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.08 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.98 
 
 
481 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.2 
 
 
250 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.82 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 
634 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>