More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3988 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  308  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  71.25 
 
 
160 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  45.34 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  48.32 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  43.31 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  44.74 
 
 
163 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  43.12 
 
 
163 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  42.75 
 
 
160 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  43.12 
 
 
163 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  43.12 
 
 
163 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  40.14 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  42.65 
 
 
160 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  42.5 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  43.88 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  42.03 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  37.5 
 
 
161 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  38.36 
 
 
161 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  41.3 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  40.38 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  41.61 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  38.46 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  39.75 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  39.86 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  39.86 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  41.94 
 
 
187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  39.58 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  43.48 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  43.48 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  43.48 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  49.65 
 
 
188 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  38.31 
 
 
161 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  39.24 
 
 
164 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  42.76 
 
 
163 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  40.15 
 
 
161 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  36.13 
 
 
168 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  40.58 
 
 
159 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  37.82 
 
 
158 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  40.15 
 
 
163 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  39.62 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  39.62 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  39.62 
 
 
164 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  38.99 
 
 
164 aa  101  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  38.99 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  38.99 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  38.61 
 
 
170 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  38.36 
 
 
164 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  38.36 
 
 
164 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  35.85 
 
 
161 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  38.52 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  34.81 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  29.81 
 
 
182 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.12 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  35.97 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.72 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  30.38 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.01 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  25.85 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.54 
 
 
538 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  31.25 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  31.25 
 
 
189 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
247 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.91 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.56 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  27.7 
 
 
436 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.56 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.58 
 
 
331 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  28.97 
 
 
346 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.58 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
395 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.29 
 
 
395 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.25 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.77 
 
 
269 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.52 
 
 
352 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.86 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0346  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  24.72 
 
 
352 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.715364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.68 
 
 
267 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.86 
 
 
352 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0805152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2588  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  28.95 
 
 
486 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.97 
 
 
221 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  28.57 
 
 
265 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 
524 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.62 
 
 
266 aa  54.7  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0979  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.86 
 
 
395 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.363777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.29 
 
 
519 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.05 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1835  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.1 
 
 
388 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0835856  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  27.61 
 
 
273 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.8 
 
 
286 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.93 
 
 
481 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.62 
 
 
397 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.2 
 
 
398 aa  53.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 
244 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0559  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.91 
 
 
352 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0634  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.26 
 
 
354 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 
244 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.48 
 
 
244 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.99 
 
 
229 aa  52  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.56 
 
 
213 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.55 
 
 
588 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>