95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2940 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  54.79 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  54.05 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  48.72 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  47.37 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  51.35 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  50 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  48.68 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  46.48 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  50.85 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  50.85 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  50.85 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  50.85 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  43.66 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  49.28 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  41.43 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  42.86 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  40 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  40.28 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  52.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  44.3 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  44.3 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  44.3 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  38.96 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  42.31 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  33.33 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  39.71 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  47.69 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  46.77 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  43.48 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  43.48 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  38.1 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  42.65 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  37.14 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  37.14 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  42.65 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  43.75 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  48.21 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  33.77 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  33.77 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  36.36 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  35.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  39.44 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  35.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 455 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2501  ferredoxin-type protein NapF  55.56 
 
 		 45 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.55 
 
 		 370 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  29.58 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09830  2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.74 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  32.61 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  37.7 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 		 653 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524548  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  34.09 
 
 		 341 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0974  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 658 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.540369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 		 660 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 658 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 658 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  33.82 
 
 		 369 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 658 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.89 
 
 		 286 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 1021 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.58 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  33.33 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  38.98 
 
 		 482 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  37.93 
 
 		 644 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 1009 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 749 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  37.1 
 
 		 447 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 538 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  33.33 
 
 		 339 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  36.54 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.45 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  40.43 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1209  heterodisulfide reductase, A subunit  39.39 
 
 		 660 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 1010 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 372 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.012041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 990 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  34.85 
 
 		 507 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 1116 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.22 
 
 		 1126 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 368 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 508 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.74 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 588 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 		 399 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  44.68 
 
 		 542 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>