148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0442 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
179 aa  360  6e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  42.05 
 
 
160 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.46 
 
 
171 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  40.14 
 
 
165 aa  94.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  36.73 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  36.05 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  36.73 
 
 
164 aa  91.3  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1932  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000184693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0864  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.3 
 
 
155 aa  90.9  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1720  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.3 
 
 
154 aa  88.2  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.774075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  36.17 
 
 
163 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  36.17 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  36.17 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  36.17 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  38.13 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  32.86 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  37.41 
 
 
161 aa  85.1  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  33.81 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  33.81 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  33.81 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  34.56 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.68 
 
 
156 aa  84.3  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  33.79 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  35.62 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  36.23 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  36.03 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  36.43 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  33.95 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  36.43 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  35.97 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  34.53 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  35.25 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  32.32 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  33.8 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  34.04 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  33.57 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  32.86 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  35.04 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  30.86 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  32.86 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  35.17 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  32.86 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  33.81 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  30.57 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  33.33 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  31.39 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  32.39 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  36.17 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.81 
 
 
470 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  28.41 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  28.41 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.41 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.75 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  34.78 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.86 
 
 
247 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.86 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.49 
 
 
244 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  30.08 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.27 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
656 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  30.26 
 
 
256 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.44 
 
 
250 aa  52  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.81 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.36 
 
 
230 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.66 
 
 
204 aa  51.2  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  35.77 
 
 
277 aa  51.2  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.29 
 
 
213 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.86 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.81 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.81 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1357  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
502 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  27.89 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  30.29 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.61 
 
 
524 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  26.67 
 
 
270 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 
104 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  29.81 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.19 
 
 
244 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.86 
 
 
244 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  30.46 
 
 
244 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.01 
 
 
507 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.14 
 
 
267 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.06 
 
 
397 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.568365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  29.03 
 
 
221 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0069  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.06 
 
 
397 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.416863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.24 
 
 
510 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1528  ferredoxin  32.81 
 
 
279 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.81 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>