158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1287 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.54 
 
 
470 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0867  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.31 
 
 
255 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.67 
 
 
249 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.95 
 
 
231 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  34 
 
 
244 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  34 
 
 
244 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.85 
 
 
230 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.5 
 
 
251 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  34 
 
 
244 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.5 
 
 
244 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  33 
 
 
244 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  37.31 
 
 
222 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.96 
 
 
231 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.96 
 
 
231 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.53 
 
 
255 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.16 
 
 
230 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.96 
 
 
231 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.96 
 
 
231 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.5 
 
 
244 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  36.88 
 
 
221 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.77 
 
 
274 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.47 
 
 
231 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.67 
 
 
241 aa  101  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.5 
 
 
243 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  33.33 
 
 
271 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.67 
 
 
246 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.67 
 
 
246 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.58 
 
 
250 aa  98.6  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.5 
 
 
244 aa  97.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.53 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  36.14 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.56 
 
 
264 aa  94.7  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.15 
 
 
299 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.91 
 
 
250 aa  94.7  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  37.04 
 
 
290 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4737  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  36.48 
 
 
224 aa  91.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242853  normal  0.472407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  32 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  35.06 
 
 
220 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  32.34 
 
 
263 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.26 
 
 
209 aa  87.8  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  32.73 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  34.13 
 
 
256 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  31.53 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  32.96 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.92 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  32.28 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.41 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.4 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.37 
 
 
507 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.8 
 
 
524 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  29.95 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  34.03 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  29.05 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.54 
 
 
510 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.72 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  32.92 
 
 
518 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  31.33 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  31.33 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  31.33 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  35.86 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.16 
 
 
528 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  34.87 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 
656 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.95 
 
 
528 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000774467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.32 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  35.25 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.9 
 
 
538 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  34.53 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.8 
 
 
591 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  36.88 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  34.01 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.87 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1566  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.14 
 
 
290 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00608017  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  30.26 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  26.83 
 
 
242 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1301  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.26 
 
 
246 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  31.29 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  30.2 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  31.29 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  30.87 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  32.67 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  32.67 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0443  iron-sulfur protein  25.33 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.442554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  35 
 
 
158 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  30.94 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  30.94 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  30.94 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  30.94 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>