193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1017 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  72.58 
 
 
246 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  72.58 
 
 
246 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0867  quinol dehydrogenase periplasmic component  58.47 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  58.57 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  56 
 
 
251 aa  285  5e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.81 
 
 
250 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.17 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  48.28 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.43 
 
 
274 aa  254  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.07 
 
 
244 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.29 
 
 
243 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  52.58 
 
 
250 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.57 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  50.21 
 
 
244 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.57 
 
 
244 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.93 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.77 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.35 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.2 
 
 
290 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.36 
 
 
244 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  50.75 
 
 
239 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  48.11 
 
 
256 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  46.05 
 
 
270 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.49 
 
 
230 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.33 
 
 
231 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  50.8 
 
 
299 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.87 
 
 
231 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.58 
 
 
230 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.61 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.81 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.15 
 
 
231 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.15 
 
 
231 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  48.94 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  44 
 
 
256 aa  198  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.7 
 
 
231 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  47.24 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  44.5 
 
 
220 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  44.12 
 
 
222 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.38 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4737  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  41 
 
 
224 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242853  normal  0.472407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  43.5 
 
 
221 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.83 
 
 
470 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1301  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.15 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 
192 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.55 
 
 
213 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.54 
 
 
524 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0006  iron-sulfur protein  29.36 
 
 
220 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000466888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.16 
 
 
507 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.55 
 
 
174 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1566  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.62 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00608017  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 
221 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.08 
 
 
504 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  31.88 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0443  iron-sulfur protein  27.56 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.442554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  33.17 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
510 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  33.7 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.78 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  28.99 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.46 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000774467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.97 
 
 
656 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.69 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.05 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  32.35 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.43 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
538 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.08 
 
 
519 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  28.4 
 
 
160 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  27.91 
 
 
168 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.93 
 
 
588 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  25 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  28.18 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  25.97 
 
 
164 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  29.87 
 
 
159 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.28 
 
 
645 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  27.81 
 
 
160 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  25.97 
 
 
164 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  31.17 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  27.22 
 
 
160 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  27.22 
 
 
160 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  25.32 
 
 
164 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  27.06 
 
 
161 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  25.32 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  27.06 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  27.06 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  25.32 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  27.71 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  25.32 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>