157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1057 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.74 
 
 
244 aa  218  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  51.02 
 
 
231 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  50.51 
 
 
231 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.41 
 
 
243 aa  207  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  50 
 
 
231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  50 
 
 
231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  50 
 
 
231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  50 
 
 
231 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  50 
 
 
231 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.87 
 
 
230 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.96 
 
 
244 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  50.5 
 
 
270 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.48 
 
 
230 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.71 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.73 
 
 
250 aa  194  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.81 
 
 
244 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.81 
 
 
244 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.44 
 
 
244 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  52.6 
 
 
239 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.32 
 
 
244 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.44 
 
 
244 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  43.48 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  46.73 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  46.73 
 
 
263 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.79 
 
 
264 aa  184  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.45 
 
 
299 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.59 
 
 
274 aa  184  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.12 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  46.15 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  41.18 
 
 
271 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  43.96 
 
 
255 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0867  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.72 
 
 
255 aa  175  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.72 
 
 
250 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  45.9 
 
 
221 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.79 
 
 
246 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.79 
 
 
246 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.03 
 
 
251 aa  166  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  41.75 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.35 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4737  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  43.17 
 
 
224 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242853  normal  0.472407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  40.49 
 
 
234 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1301  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.69 
 
 
246 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.98 
 
 
470 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0443  iron-sulfur protein  32.88 
 
 
224 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.442554  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0006  iron-sulfur protein  33.66 
 
 
220 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000466888  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.37 
 
 
174 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1566  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.04 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00608017  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.74 
 
 
507 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.95 
 
 
510 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.08 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.97 
 
 
221 aa  89  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  36.17 
 
 
518 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.05 
 
 
528 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000774467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 
528 aa  85.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  30.63 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.6 
 
 
656 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  33 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.36 
 
 
591 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.05 
 
 
229 aa  79  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  31.28 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.77 
 
 
524 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
504 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.28 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  31.82 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.16 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.12 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  32.14 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.06 
 
 
519 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
645 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  28.4 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  27.5 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  28.92 
 
 
172 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  27.5 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  35.45 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  29.35 
 
 
165 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  32.5 
 
 
159 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  26.88 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  28.83 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  26.88 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  26.88 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  29.56 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  29.56 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  27.5 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  29.56 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  32.24 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  26.88 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  26.88 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.29 
 
 
538 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  28.3 
 
 
168 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>