More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3028 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
221 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.33 
 
 
213 aa  278  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  60.2 
 
 
219 aa  238  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  52.07 
 
 
242 aa  225  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  51.18 
 
 
206 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.77 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  41.98 
 
 
226 aa  167  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.44 
 
 
209 aa  141  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.71 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 
247 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.75 
 
 
204 aa  95.9  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.49 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.72 
 
 
274 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.5 
 
 
244 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.01 
 
 
250 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0867  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.49 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.69 
 
 
249 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.42 
 
 
510 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.41 
 
 
470 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 
504 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  33.7 
 
 
518 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.47 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.47 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.47 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.47 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
656 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.97 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.53 
 
 
528 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.54 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000774467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.97 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.15 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.49 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.98 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.43 
 
 
519 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.2 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.95 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  35.38 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.54 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.66 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.63 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.82 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  31.91 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  31.44 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.82 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.68 
 
 
538 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.01 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.46 
 
 
507 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.18 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  32.52 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.52 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  37.11 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  34.25 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  30 
 
 
251 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.19 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  35.26 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  32.28 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  31.65 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.32 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.83 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.7 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  33 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  29.28 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  29.28 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  32.97 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.24 
 
 
591 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  35.22 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  29.28 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  29.28 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  29.8 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  32.11 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  35.57 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  32.79 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  32 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  32.07 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  28.73 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.28 
 
 
290 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  28.73 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  28.73 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  34.42 
 
 
168 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  33.33 
 
 
161 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  28.73 
 
 
164 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  28.09 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  30.92 
 
 
161 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  27.07 
 
 
164 aa  62.4  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  31.79 
 
 
158 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  31.79 
 
 
158 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  27.62 
 
 
167 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  29.52 
 
 
163 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  27.62 
 
 
167 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>